却说秦府僚佐长孙无忌、尉迟敬德等闻此消息，入告知秦王曰：“元吉出师，欲因其兵作乱。愿大王先事图之。”世民叹曰：“骨肉相残，古今大恶。吾诚知祸在旦夕，欲待其事发，然后以义讨之，不亦可乎？”敬德曰：“人情谁不贪生怕死？今众人誓死从王，乃天授也。大王不用敬德之言，敬德将窜身草泽，不敢留于大王左右，交手受戮也。”无忌曰：“不从敬德之言，无忌亦当相辞而去。不能服事大王矣。”世民曰：“寡人之谋，未可全弃。公等再思之。”敬德曰：“处事有疑，非智；临难不决，非勇。大王素所蓄养勇士八百余人，今悉入宫，披甲执刀矣。事势已成，大王安能稳坐乎？”世民怀疑，复访之府僚。府僚皆曰：“齐王凶戾，终不肯事其兄。尝谓其护军薛实曰：‘但除秦王，取东宫如反掌耳。’今彼与太子谋乱未成，已有害太子之心，足见齐王乱心无厌，何所不至。若使二人得志，天下非复唐有。大王以舜为何如人？”世民曰：“舜乃圣人也。”众曰：“昔舜之弟象欲谋杀兄，使舜穿井。舜既入，瞽瞍令人下土寒井，舜乃从井孔旁而出。象见其谋未成，又使舜上涂仓廪。舜既上，瞽瞍从下焚廪。舜乃以两笠自捍而下得免。使舜当时穿井而不出，涂廪而不下，则舜为井中之泥、廪上之灰耳，安能泽被天下，法垂后世乎？是以小杖则受，大杖则走。盖所存者大也。”
世民见众议恳切，乃命卜其吉凶。忽幕僚张公谨自外来见之，取龟壳投于地曰：“凡卜所以决疑。今事在不疑，何用卜哉！使卜而不吉，其可已乎？”世民意乃决。司天台官傅奕密奏：“太白再经天见于秦分，应秦王当有天下。”时武德九年夏六月也。次日，秦王入奏建成元吉淫乱后宫，且曰：“二人专欲杀臣，以为世充、建德复仇，使臣虽死亦耻见诸贼于地下。”言罢，伏而恸哭。高祖惊曰：“朕不知太子欲危社稷。明日当鞠问。汝宜早入证之。”世民乃退出府中，与长孙无忌等相议。无忌曰：“先发者制人，大王随集甲士预备，以防不测。”世民即召程知节、秦叔宝、尉迟敬德部甲士埋伏于玄武门，候有动静即出。程知节等各领诺去了。
却说高祖欲鞠太子，消息闻入宫中。张婕好遣人告知建成。建成惊惧，召元吉谋之曰：“事已亟矣！秦王令部下假以讨我等为名，实欲夺关中而僭帝位。吾今令薛万彻监兵自守，不入朝，以观形势。尔为何为？”元吉曰：“兵备已严，当俱入朝，自问消息。世民之众如顺者，太子以言抚之，而纳为心腹；如不顺者，即杀之以警其余。如此则人心恐惧，而不与敌，则天下自定矣。”建成从之，乃俱入至临湖殿。只听阙下摇旗呐喊，兵甲之声达于内外。建成见势头不好，勒回马便走。秦王拈弓在手，望后追赶，一矢射中，建成坠马，即杀之于禁宫。死年三十八岁。秦王复追元吉。元吉走上数步，将取弓回矢射之，忽掖门边一将怒气冲天，咬牙切齿，乃尉迟敬德也，元吉见他来的势恶，复抽身而走。敬德大呼，挽弓射之，元吉坠马，敬德近前枭下首级。死年二十四岁。
是时，东宫、齐府将帅薛万彻等，听得宫中厮杀，率众大至，攻玄武门。秦叔宝、程知节引骑兵冲突而入，与建成甲士鏖战不止，宫中震动，死及无辜者不计其数。敬德闻宫外喊声不绝，即将建成、元吉首级从门掖中掷下。薛万彻众人见了首级，各散去。世民出临湖殿，与长孙无忌合兵一处。众人见诛了建成、元吉，乃拱手称贺曰：“吾所患者，惟是二人。大王并除之，天下自此定矣。”世民曰：“非吾之能，乃兄弟罪恶贯盈，致诸君赞助之力也。”言未罢，忽有人来报：“皇上方泛舟于海池，闻王诛太子及齐王，惊惶无措，欲自为计。”世民大惊，即使敬德入侍禁卫。
司马温公曰：立嫡以长礼之正也，然高祖所以有天下皆太宗之功德。太子以庸劣居其右，地嫌隙逼，必不相容。向使高祖有太王之明德，太子有泰伯之贤，太宗有子臧之节，则乱何自而生哉？既不能然，太宗始欲俟其先发，然后应之。如此，则事非获已，犹为愈也。既而为群下所迫，遂至喋血禁门，推刃同气，贻讥千古。惜哉！夫创业垂统之君，子孙之所仪刑也。彼中明肃代之传继，得非有所指疑以为口实乎？
静轩周先生读史至此，有感作诗曰：亲亲恩义总乖违，太子缘何苦执迷？惟识奸贪危社稷，遂忘祸患起宫闱。全谋决策由无忌，枭首监兵有尉迟。掩卷追思前代事，不胜哀感泪沾衣。
却说世民已受东宫之位，即命纵放禁苑鹰犬，罢四方贡献，听百官各陈治道。自是政令简肃，中外大悦。召台司傅奕，谓之曰：“汝前所奏，几为吾祸。凡有休祥大变，卿宜尽言。勿以前事为戒也。”傅奕顿首称谢。近臣请收建成、元吉诸子，皆坐诛。世民曰：“二人之恶虽甚，以皇上视之，皆同气也。岂可尽夷灭之？有伤国体。吾当奏上赦之。”诸将又欲尽诛东宫、齐府左、右百余人，敬德曰：“为恶者二人，今已诛矣。若又收其支党，非所以求安也。”世民曰：“敬德之言是也。”即下令东宫、齐府左、右悉赦之不究。由是中外乃安。敬德曰：“建成僚佐，魏徵、王珪最贤，太子可召之共理国事。”世民曰：“公不言，吾几忘之！”即遣人召魏徵。
魏徵来见，世民谓之曰：“汝何为离间我兄弟？”徵举止自若，对曰：“太子建成早从徵言，必无今日之祸。”太子世民改容谢曰：“卿之忠义，吾所素闻矣。”甚礼重之，引为詹事主簿。取回王珪、韦挺于＊州，皆以为谏议大夫。亦召房玄龄、杜如晦等。自是齐王潜逐出者，悉归京师。
范氏有断魏徵云：闻之程子，齐桓公杀公子纠，召忽死之。管仲不死，又相桓公以霸。而孔子取之，何载？桓公子纠，皆以公子出奔，子纠未尝为世子也。桓公先入而得齐，非取诸子纠也。桓公既入而杀子纠。恶则恶矣，然纳桓公者齐也。《春秋》书公伐齐纳纠，不称子，不当立者也。齐小白入于齐，以小白系之齐，当立者也。是以，管仲不得仇桓公，而得以之为君。建成为太子，且兄也。秦王为藩王，又弟也。王、魏受命为东宫之臣，则建成其君也。岂有人杀其君而可北面为之臣乎？以弟杀兄，以藩王杀太子，而夺其位，太宗亦非可事之君矣。食君之禄，而不死其难，朝以为仇，暮以为君，于其不可事而事之，皆有罪焉。臣之事君，如妇之从夫也，其义不可以不明。苟不明于义，而委质于人，虽曰不利吾不信也。